Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNX12Q9UMY4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SNX12Q9UMY4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms