Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms