Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNPO1Q92973 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms