Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZBED5Q49AG3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZBED5Q49AG3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms