Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD55Q3KP44 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms