Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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TNXAQ16473 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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TNXAQ16473 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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TNXAQ16473 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNXAQ16473 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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TNXAQ16473 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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TNXAQ16473 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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