Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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