Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CENPBD1P1-206ENST00000493504 3282 ntTSL 1 (best)12.58□□□□□ -0.42e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 S100A1-205ENST00000469893 2621 ntTSL 1 (best)12.54□□□□□ -0.41e-15■■■■□ 19.9
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PABPC4Q13310 APOM-201ENST00000375916 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.542e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 APOM-203ENST00000375920 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.542e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 MEF2C-209ENST00000504921 7561 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.62e-8■■■■□ 19.9
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PABPC4Q13310 MCM8-204ENST00000378896 3769 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.852e-6■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 MCM8-202ENST00000378883 3574 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.882e-6■■■■□ 19.9
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PABPC4Q13310 VAMP3-201ENST00000054666 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.942e-8■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.962e-6■■■■□ 19.9
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PABPC4Q13310 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.171e-15■■■■□ 19.9
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PABPC4Q13310 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.281e-15■■■■□ 19.9
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PABPC4Q13310 RPS11-201ENST00000270625 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.584e-50■■■■□ 19.9
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PABPC4Q13310 RPS11-208ENST00000601306 547 ntTSL 38.48□□□□□ -1.054e-50■■■■□ 19.9
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PABPC4Q13310 GPAT4-209ENST00000521349 842 ntTSL 221.09■□□□□ 0.974e-6■■■■□ 19.9
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PABPC4Q13310 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.761e-6■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.11e-6■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 NOP53-203ENST00000594525 876 ntTSL 1 (best)15.75■□□□□ 0.116e-9■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.182e-7■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 METRN-203ENST00000567076 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 529.42■■■□□ 2.32e-6■■■■□ 19.9
PABPC4Q13310 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.522e-14■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 323.87■■□□□ 1.411e-8■■■■□ 19.8
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PABPC4Q13310 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.167e-12■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.167e-12■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.779e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.299e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.129e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 HSF1-214ENST00000614796 1724 ntTSL 521.9■■□□□ 1.12e-7■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.511e-12■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 MTCH2-205ENST00000534074 811 ntTSL 26.06□□□□□ -1.441e-12■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 MTCH2-206ENST00000539759 581 ntTSL 55.54□□□□□ -1.521e-12■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 GUK1-222ENST00000477206 589 ntTSL 220.8■□□□□ 0.925e-7■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 GUK1-217ENST00000465025 783 ntTSL 217.88■□□□□ 0.455e-7■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 RRP1-202ENST00000471909 2544 ntTSL 1 (best)19.21■□□□□ 0.676e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.416e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 RRP1-201ENST00000467112 3019 ntTSL 1 (best)16.3■□□□□ 0.26e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.695e-10■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 DBI-205ENST00000460901 774 ntTSL 1 (best)20.55■□□□□ 0.885e-10■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.855e-10■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.685e-10■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.635e-10■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.435e-10■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 DBI-202ENST00000355857 637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.135e-10■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 DBI-209ENST00000535757 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.215e-10■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 DBI-204ENST00000409094 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.215e-10■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 DBI-206ENST00000475783 842 ntTSL 1 (best)13.32□□□□□ -0.285e-10■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 DBI-208ENST00000535617 654 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.485e-10■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.185e-8■■■■□ 19.8
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