Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
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RAB40BQ12829 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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RAB40BQ12829 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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RAB40BQ12829 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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RAB40BQ12829 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB40BQ12829 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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