Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ST3GAL4Q11206 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ST3GAL4Q11206 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms