Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC15Q0P6D6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms