Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms