Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA8P48165 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA8P48165 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA8P48165 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA8P48165 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA8P48165 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA8P48165 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA8P48165 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA8P48165 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA8P48165 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA8P48165 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA8P48165 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA8P48165 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA8P48165 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA8P48165 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA8P48165 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA8P48165 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA8P48165 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA8P48165 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA8P48165 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA8P48165 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA8P48165 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA8P48165 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA8P48165 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA8P48165 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA8P48165 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA8P48165 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA8P48165 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA8P48165 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA8P48165 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA8P48165 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA8P48165 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA8P48165 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA8P48165 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA8P48165 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA8P48165 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA8P48165 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA8P48165 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA8P48165 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA8P48165 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA8P48165 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA8P48165 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA8P48165 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA8P48165 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA8P48165 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA8P48165 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA8P48165 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA8P48165 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA8P48165 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA8P48165 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA8P48165 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA8P48165 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA8P48165 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA8P48165 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA8P48165 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA8P48165 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA8P48165 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA8P48165 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA8P48165 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA8P48165 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA8P48165 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA8P48165 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms