Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPGP40121 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPGP40121 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPGP40121 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPGP40121 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPGP40121 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPGP40121 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPGP40121 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPGP40121 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CAPGP40121 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms