Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms