Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS6KB1P23443 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS6KB1P23443 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms