Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP2C9P11712 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP2C9P11712 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYP2C9P11712 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP2C9P11712 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms