Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFNA2P01563 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms