Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF559-213ENST00000603380 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF9-205ENST00000437457 3758 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR36-206ENST00000612402 6592 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CICP26-201ENST00000425003 2448 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MRAS-211ENST00000621127 3801 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 USP6NL-201ENST00000277575 4512 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MRAS-201ENST00000289104 4538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FRMPD3-201ENST00000276185 7304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KCND3-203ENST00000369697 7396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TNFRSF9-204ENST00000615230 5970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF248-208ENST00000611278 4204 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 C12orf56-201ENST00000333722 3936 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NT5E-203ENST00000369651 3918 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL590483.3-201ENST00000623669 3580 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ATG4C-203ENST00000371120 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GAD1-202ENST00000358196 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 BRCA1-208ENST00000468300 3273 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DDIAS-207ENST00000528759 3278 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TENM2-207ENST00000520394 8034 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DHX29-205ENST00000621106 4450 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC134682.1-201ENST00000569285 3377 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 STRADA-202ENST00000336174 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RMI1-201ENST00000325875 3420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SZRD1-210ENST00000492354 3401 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF175-201ENST00000262259 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL160006.1-201ENST00000554749 4216 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ACTN3-201ENST00000502692 3084 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF11-201ENST00000361409 5788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RBBP9-201ENST00000337227 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 VPS11-207ENST00000620429 2739 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LHX9-203ENST00000367390 7413 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC25A36-208ENST00000507429 3537 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC009108.3-201ENST00000602739 3515 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ABCC5-202ENST00000334444 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CDK16-204ENST00000457458 3158 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 IGHMBP2-201ENST00000255078 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ENOX2-203ENST00000370935 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ADA2-204ENST00000399839 3986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZC3H13-202ENST00000282007 6412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MSRB3-201ENST00000308259 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 BDNF-204ENST00000395980 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MED23-202ENST00000368053 2811 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZC3HC1-201ENST00000311873 2017 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNHIT6-202ENST00000431532 6080 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFYVE1-208ENST00000556143 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.9 ms