Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCMF1Q9P0J7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms