Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM120AQ9NZB2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.256e-9■■■□□ 17.7
FAM120AQ9NZB2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.735e-9■■■□□ 17.7
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FAM120AQ9NZB2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.165e-9■■■□□ 17.7
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FAM120AQ9NZB2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.931e-8■■■□□ 17.6
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FAM120AQ9NZB2 SECTM1-203ENST00000581691 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.22□□□□□ -0.611e-8■■■□□ 17.6
FAM120AQ9NZB2 SECTM1-206ENST00000582290 583 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.1□□□□□ -0.631e-8■■■□□ 17.6
FAM120AQ9NZB2 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.651e-8■■■□□ 17.6
FAM120AQ9NZB2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.411e-6■■■□□ 17.6
FAM120AQ9NZB2 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 327.29■■□□□ 1.961e-6■■■□□ 17.6
FAM120AQ9NZB2 MACROD1-206ENST00000542359 459 ntTSL 317.09■□□□□ 0.331e-6■■■□□ 17.6
FAM120AQ9NZB2 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.272e-6■■■□□ 17.6
FAM120AQ9NZB2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.626e-11■■■□□ 17.6
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FAM120AQ9NZB2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.051e-13■■■□□ 17.6
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FAM120AQ9NZB2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.062e-8■■■□□ 17.5
FAM120AQ9NZB2 JPT2-213ENST00000569256 911 ntTSL 1 (best)19.36■□□□□ 0.696e-21■■■□□ 17.5
FAM120AQ9NZB2 JPT2-209ENST00000566742 593 ntTSL 418.06■□□□□ 0.481e-8■■■□□ 17.5
FAM120AQ9NZB2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.971e-7■■■□□ 17.5
FAM120AQ9NZB2 C14orf80-218ENST00000548920 1358 ntTSL 527.35■■□□□ 1.971e-7■■■□□ 17.5
FAM120AQ9NZB2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.851e-7■■■□□ 17.5
FAM120AQ9NZB2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.741e-7■■■□□ 17.5
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