Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf4Q9NR00 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms