Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms