Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms