Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms