Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNNM3Q8NE01 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNNM3Q8NE01 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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