Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRP13Q86W25 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms