Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LRSAM1Q6UWE0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms