Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TYW3Q6IPR3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TYW3Q6IPR3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms