Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH4AQ5TD94 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH4AQ5TD94 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms