Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAPCD1Q5SSQ6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms