Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms