Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NTRK3Q16288 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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