Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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