Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NHLH2Q02577 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NHLH2Q02577 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms