Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBA52P62987 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBA52P62987 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBA52P62987 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBA52P62987 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBA52P62987 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBA52P62987 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBA52P62987 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBA52P62987 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBA52P62987 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBA52P62987 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBA52P62987 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBA52P62987 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBA52P62987 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UBA52P62987 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBA52P62987 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBA52P62987 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBA52P62987 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBA52P62987 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBA52P62987 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBA52P62987 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBA52P62987 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBA52P62987 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBA52P62987 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBA52P62987 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
UBA52P62987 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBA52P62987 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBA52P62987 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms