Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms