Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms