Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CYLDQ9NQC7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CYLDQ9NQC7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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