Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1B3Q9NPD5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms