Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR3CQ9C0K3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms