Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MRPL53Q96EL3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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