Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
C15orf40Q8WUR7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf40Q8WUR7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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