Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L4Q8WU68 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms