Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF20Q5VTR2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms