Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP78Q5JTW2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms