Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
XRCC4Q13426 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
XRCC4Q13426 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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