Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPC1P35052 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPC1P35052 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPC1P35052 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPC1P35052 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPC1P35052 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPC1P35052 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPC1P35052 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPC1P35052 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPC1P35052 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPC1P35052 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPC1P35052 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPC1P35052 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPC1P35052 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPC1P35052 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPC1P35052 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPC1P35052 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPC1P35052 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPC1P35052 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPC1P35052 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPC1P35052 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPC1P35052 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPC1P35052 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GPC1P35052 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GPC1P35052 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms