Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GP1BBP13224 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms