Protein–RNA interactions for Protein: P01861

IGHG4, Immunoglobulin heavy constant gamma 4, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG4P01861 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IGHG4P01861 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms